「超能力開發研究所」突然遭到無數不明生命體的攻擊,研究所已經完全被破壞殆盡。混亂中,原本在研究所中被實驗的超能力者小雷(10歲)與紗綾香(12歲)趁隙逃了出來。數月之後,不明生命體的政擊再度出現,這次的目標竟然是紗綾香,翔一聞訊之後立即變身為假面騎士顎門,與G3-X一同前住救援。突然間,G4出現了,他的出現讓眾人非常驚訝。因為在兩個月前,G4的藍圖被盜,它的力量強大,但是穿戴它的人往往受不了而致命,到底是誰偷走G4後又製造它?不明生命體的攻擊到底來自何方?假面騎士顎門,G3-X,G4與不明生命體之間的戰爭即將開打!!Shouichi, Ryo, and Hikawa have to combat a new wave of Overlords, but are faced with another threat in the form of G4, another Battle Suit designed to fight the Overlords, but is potentially stronger and is on the wrong side.